In folgenden Organisationen ist die Dr. Scheller Stiftung Mitglied:
- Bundesverband Deutscher Stiftungen e.V.
- BUND für Umwelt und Naturschutz e.V.
- Forstbetriebsgemeinschaft Peine-Braunschweig
- Forstgenossenschaft Hordorf
- Forstgenossenschaft Schöppenstedt
- Geopark-Trägerverein Braunschweiger Land . Ostfalen e.V.
- Nationales Netzwerk Natur
- Natur-Netz-Niedersachsen e.V.
- Paläontologische Gesellschaft